自闭症的病因尚不清楚。流行病学研究筛查了许多可能的自闭症风险因素，但没有一个是直接原因。一般认为，基因变异与不利环境的相互作用，特别是新生突变，可能是导致自闭症的主要原因，但具体的致病因素和机制尚不清楚。研究表明，年龄较大的父母、怀孕期间的感染、怀孕早期不良的药物或化学物质接触等因素可能会增加患自闭症的风险。